办理公司员工深户迁出手续需要注意以下几个方面：
第一步：准备材料
1. 身份证原件和复印件；
2. 户口本原件和复印件；
3. 工作单位开具的注销证明；
4. 公积金、社保等相关证明原件和复印件。
第二步：去办理手续
员工可以到深圳市人才落户服务中心办理迁出手续，具体地址和办理时间可以在官网上查询。在办理的过程中要按照相关流程进行，材料要准备完整，并遵守规定的时间和地点。
第三步：等待审核
提交申请后需要等待相关部门审核，审核通过后会收到相关通知或证明。
总的来说，办理员工深户迁出手续需要提前了解申请条件和准备相关材料，按照流程进行操作，耐心等待审核，最后成功迁出深户。