代理深户和自行办理深户的差异明显，在代理深户方面，代理机构会提供一站式服务，帮助客户进行深户申请，节省了大量时间和精力。与此同时，代理深户还可以确保申请过程的顺利进行，尤其是对于初次申请深户的客户，代理机构可以提供专业人员解答疑问，并为客户筹备材料。
然而，代理深户也存在一些缺点。最明显的是代理费用，一般在1800-2000元之间，而户政中心除了工本费不收取其他费用，需要落户体检大概费用是500左右。此外，如果需要缴纳社保和满足其他条件方可办理深户，也需要额外开支。因此，对于只是为了省时间和精力的客户而言，代理深户可能并不划算。
对于自行办理深户，客户需要提前了解深户申请的条件和要求，并准备好相应的材料。虽然相比代理深户，自行办理需要投入更多的时间和精力，但是客户可以节省代理费用并且可以直接了解整个申请过程。此外，对于条件不满足或需要办理落户的客户，自行办理深户也是唯一的选择。
总的来说，代理深户与自行办理深户之间存在着明显的差异。代理深户方便快捷但需要承担额外的代理费用，而自行办理深户需要投入更多的时间和精力，但可以直接了解整个申请过程和节省代理费用。因此，客户需要根据自己的具体情况，权衡利弊，选择最适合自己的深户申请方式。