企业纳税入户是指企业在深圳市内进行注销和迁入登记手续，使企业在深圳市内纳税并享受相应的税收优惠政策。在进行纳税入户手续时，申请人需准备的证明文件如下：
1.企业法人营业执照：企业法人营业执照是进行企业纳税入户手续的重要证明文件，申请人需携带企业营业执照原件及复印件。
2.税务证明：纳税入户需要提供近三个纳税年度内的税务证明，包括企业所得税、增值税、消费税等相关税种，证明企业在深圳市内有较高的纳税记录。
3.银行开户证明：申请人需提供企业在深圳市内银行的开户证明，证明企业在深圳市内进行银行业务及资金流转。
4.房屋证明：企业需提供自己或租用的办公场所的房屋证明，证明企业在深圳市内有稳定的经营场所。
5.劳动合同及员工社保证明：如果申请人是雇佣员工的企业，需提供员工的劳动合同及社保证明，证明企业在深圳市内有稳定的人力资源。
除了以上证明文件，企业纳税入户还需要满足相关的条件，如纳税额达到一定标准、年龄不超过50周岁等条件。如果不符合条件，企业可以通过积分入户方式进行申请。
总之，企业纳税入户手续需要提供的证明文件较多，同时需满足一定的条件，为了更好地进行纳税入户，企业可委托代办机构进行申请，但需注意代办机构的收费标准及专业性。