在深圳，企业申请入户纳税申报，需要注意以下几个问题。
首先，申请人的身份和纳税条件需要符合以下其中一项：最近连续3个纳税年度内纳税额累计在300万元以上的企业法定代表人或负责人；最近连续3个纳税年度内纳税额累计在60万元以上的个人独资企业所有人，或以本人投资份额占企业实收资本的比例分摊企业纳税额累计在60万元以上的有限责任公司自然人股东、合伙企业出资（合伙）人；最近连续3个纳税年度内纳税额累计在30万元以上的个体工商户经营者；最近连续3个纳税年度内依法缴纳个人所得税（限工资薪金所得和劳务报酬所得项目)累计24万元以上的在深圳合法就业个人。
此外，申请人的年龄也需要在50岁以下，如果纳税额超过规定1倍以上的，迁户年龄可放宽至55周岁以下（不包含55周岁）。同时，申请人所在的户口和政策问题也需要满足相关要求。
如果不能满足以上条件，只能通过积分入户的方式进行，积分系统尚未开放，可以联系相关机构，如深圳安家保，进行咨询和代办服务。
需要提醒的是，深圳企业入户纳税申报需要提交一系列材料，包括企业营业执照、税务登记证、申请人身份证、最近三年纳税证明等等。同时，由于每个申请人的情况都不同，申请人需要根据具体情况进行材料准备和申请流程。最好可以在申请前先咨询相关机构或律师事务所，以避免申请过程中出现不必要的麻烦和错误。