在深圳申请积分入户，个人档案证明需要公证认证的情况如下：
1. 学历证明：需要公证认证的是在国外获得的学位证书和成绩单。在国内获得的学位和学历证书不需要公证认证，但要提供原件和复印件。
2. 职称证明：需要公证认证职称证书以及职称评审材料原件和复印件。
3. 技能证明：需要公证认证技能证书以及技能鉴定材料原件和复印件。
4. 纳税证明：需要公证认证个人所得税完税证明原件和复印件。
5. 社保证明：需要公证认证社保缴费证明原件和复印件。
在申请时需要注意证明材料的真实性和完整性，如果存在虚假证明或遗漏重要材料，可能会影响入户申请的审批结果。同时，申请人要了解最新的政策和流程，避免在申请过程中出现不必要的错误和延误。